现在流行两种主要的液相色谱分析柱的式样，关键部件卡套有些不同。一种式样是螺母、卡套全套在柱管上，分配器和烧结过滤板按顺序放在尾部接头内。拧紧螺母和尾部接头，卡套一次成型紧紧咬住柱管外壁，起到很好的密封作用。分配器使得高压流动相不集中在一点冲击柱床，又能把由流动相带来的样品分散到柱头上均匀分离，形成对称的色谱峰。烧结过滤板的孔径<5微米，除了能缓和高压流动相对固定相的冲击，也挡住了污染物进入色谱柱柱头。
液相色谱分析柱在使用前，需要进行柱的性能测试，并将结果保存起来，作为今后评价柱性能变化的参考。但要注意：柱性能可能由于所使用的样品、流动相、柱温等条件的差异而有所不同；另外，在做柱性能测试时是按照色谱柱出厂报告中的条件进行(出厂测试所使用的条件是好的条件)，只有这样，测得的结果才有可比性。具体有以下3点：
1、样品的前处理：
a、至好使用流动相溶解样品。
b、使用予处理柱除去样品中的强极性或与柱填料产生不可逆吸附的杂质。
c、使用0.45μm的过滤膜过滤除去微粒杂质。
2、流动相的配制：
a、流动相对样品具有一定的溶解能力，保证样品组分不会沉淀在柱中(或长时间保留在柱中)。
b、流动相具有一定惰性，与样品不产生化学反应(特殊情况除外)。
c、流动相的黏度要尽量小，以便在使用较长的分析柱时能得到好的分离效果；同时降低柱压降，延长液体泵的使用寿命(可运用提高温度的方法降低流动相的黏度)。
3、流动相流速的选择：
因液相色谱分析柱是柱中流动相线性流速的函数，使用不同的流速可得到不同的柱效。对于一根特定的色谱柱，要追求更好的柱效，使用合适流速。对内径为4.6mm的色谱柱，流速一般选择1ml/min，对于内径为4.0mm柱，流速0.8ml/min为佳。
在使用液相色谱分析柱时，多注意使用注意事项可以避免一些不必要的麻烦，进而提高实验人员的工作效率，比较主要的有以下6点：
1、选择使用适宜的流动相(尤其是pH)，以避免固定相被破坏。
有时可以在进样器前面连接一预柱，分析柱是键合硅胶时，预柱为硅胶，可使流动相在进入分析柱之前预先被硅胶“饱和”，避免分析柱中的硅胶基质被溶解。
2、经常用强溶剂冲洗色谱柱，清除保留在柱内的杂质。
在进行清洗时，对流路系统中流动相的置换应以相混溶的溶剂逐渐过渡，每种流动相的体积应是柱体积的20倍左右。
3、保存色谱柱
应将柱内充满乙腈或甲醇，柱接头要拧紧，防止溶剂挥发干燥。绝对禁止将缓冲溶液留在柱内静置过夜或更长时间。
4、避免压力和温度的急剧变化及任何机械震动
温度的突然变化或者使色谱柱从高处掉下都会影响柱内的填充状况；柱压的突然升高或降低也会冲动柱内填料，因此，在调节流速时应该缓慢进行，在阀进样时阀的转动不能过缓。
5、应逐渐改变溶剂的组成
特别是反相色谱中，不应直接从有机溶剂改变为全部是水，反之亦然。
6、一般说来色谱柱不能反冲
只有生产者指明该柱可以反冲时，才可以反冲除去留在柱头的杂质。否则反冲会迅速降低柱效。
